Zakład Chemii Komponentów Kwasów Nukleinowych

dr hab. Michał Sobkowski

Kierownik Zakładu

msob@ibch.poznan.pl
tel. wew. 1182
 

mgr inż. Tomasz Modrzyński
doktorant 

dr Grzegorz Framski

starszy specjalista chemik

dr Dagmara Baraniak

adiunkt

dr hab. Tomasz Ostrowski

profesor instytutu

dr Joanna Romanowska

adiunkt

mgr Justyna Gołębiewska

asystent

• J. Golebiewska, J. Stawinski: „Reaction of Boranephosphonate Diesters with Pyridines or Tertiary Amines in the Presence of Iodine: Synthetic and Mechanistic Studies”, J. Org. Chem., 85, 4312-4323, 2020. 

• J. Romanowska, K. Kolodziej, M. Sobkowski, M. Rachwalak, T. Jakubowski, J. Golebiewska, A. Kraszewski, J. Boryski, A. Dabrowska, J. Stawinski: „Aryl H-phosphonates. 19. New anti-HIV pronucleotide phosphoramidate diesters containing amino- and hydroxypyridine auxiliaries”. Eur.J.Med.Chem. 164:47-58, 2019. 

• J. Golebiewska, M. Rachwalak, T. Jakubowski, J. Romanowska, J. Stawinski: „Reaction of Boranephosphonate Diesters with Amines in the Presence of Iodine: The Case for the Intermediacy of H-Phosphonate Derivatives”, J. Org. Chem., 83, 5496-5505, 2018.

• Szymanska-Michalak, D. Wawrzyniak, G. Framski, J. Stawinski, J. Barciszewski, A. Kraszewski: „New antiglioma zwitterionic pronucleotides with an FdUMP framework”, Eur. J. Med. Chem., 144, 682-691, 2018.

• M. Materna, J. Stawinski, A. Kiliszek, W. Rypniewski, M. Sobkowski: „Oxyonium phosphobetaines - unusually stable nucleophilic catalyst-phosphate complexes formed from H-phosphonates and N-oxides”, RSC Adv., 6, 14448-14451, 2016. 

• Z. Jahnz-Wechmann, G. Framski, P. Januszczyk, J. Boryski: „Bioactive fused heterocycles: Nucleoside analogs with an additional ring”. Eur. J. Med. Chem. 97, 388-396, 2015.

• M. Sobkowski, A. Kraszewski, J. Stawinski: „Recent Advances in H-Phosphonate Chemistry. Part 1. H-Phosphonate Esters: Synthesis and Basic Reactions”, „Part 2. Synthesis of C-Phosphonate Derivatives”, Topics in Current Chemistry, 137-177 & 179-216, 2015.

• J. Romanowska, M. Sobkowski, A. Szymanska-Michalak, K. Kolodziej, A. Dabrowska, A. Lipniacki, A. Piasek, Z. M. Pietrusiewicz, M. Figlerowicz, A. Guranowski, J. Boryski, J. Stawinski, A. Kraszewski: „Aryl H-phosphonates 17: (N-Aryl)phosphoramidates of pyrimidine nucleoside analogues and their synthesis, selected properties, and anti-HIV activity”, J. Med. Chem. 54, 6482-6491, 2011.

• M. Sobkowski. „Chemistry and stereochemistry of internucleotide bond formation by the H-phosphonate method”, New J. Chem. 34, 854-869, 2010.

• J. Boryski: „Reactions of Transglycosylation in the Nucleoside Chemistry”, Current Organic Chemistry, 12, 309-325, 2008.

• G. Framski, Z. Gdaniec, M. Gdaniec, J. Boryski: „A reinvestigated mechanism of ribosylation of adenine under silylating conditions”. Tetrahedron, 62, 10123-10129, 2006.

• J. Boryski: „Regioselectivity and Mechanism of Transpurination Reactions in the Guanine Nucleosides Series”. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 649-652, 1997.

• J. Jankowska, M. Sobkowski, J. Stawinski, A. Kraszewski: „Studies on aryl H-phosphonates. 1. An efficient method for the preparation of deoxyribo- and ribonucleoside 3'-H-phosphonate monoesters by transesterification of diphenyl H-phosphonate”, Tetrahedron Lett. 35, 3355-3358, 1994. 

• J. Stawinski, A. Kraszewski: „How to get the most out of two phosphorus chemistries. Studies on H-phosphonates”, Acc.Chem.Res., 35, 952–960, 2002.

• J. Boryski, B. Golankiewicz, E. De Clercq: „Synthesis and Antiviral Activity of Novel N-Substituted Derivatives of Acyclovir”. J. Med. Chem., 31, 1351-1355, 1988.

• P.J. Garegg, I. Lindh, T. Regberg, J. Stawinski, R. Stromberg, C. Henrichson: „Nucleoside H-phosphonates. III. Chemical synthesis of oligonucleotides by the hydrogenphosphonate approach”. Tetrahedron Lett. 27, 4051-4054, 1986.

• R. Crea, A. Kraszewski, T. Hirose, K. Itakura: „Chemical synthesis of genes for human insulin”, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 5765–5769, 1978.

• K.J. Marians, R. Wu, J. Stawinski, T. Hozumi, S.A. Narang: „Cloned synthetic lac operator DNA is biologically active”, Nature, 263, 744–748, 1976.

• Chemiczna architektura fluorowanych analogów dimerów nukleozydów zawierających łączniki 1,2,3-triazolowych o potencjalnym zastosowaniu w biologii molekularnej i medycynie. Grant NCN SONATA 15 (2019/35/D/NZ7/03637), kierownik: dr Dagmara Baraniak

• Eksploracja drugiej generacji analogów nukleotydów zawierających fosforosulfeno- lub fosforoselenoamidy jako nowe motywy strukturalne. Grant NCN PRELUDIUM 16 (2018/31/N/ST5/03589), kierownik: mgr Justyna Gołębiewska

•  

• chemia bioorganiczna,
• chemia fosforoorganiczna,
• stereochemia,
• mechanizmy reakcji,
• nukleozydy,
• nukleotydy,
• analogi nukleozydów,
• analogi nukleotydów,
• synteza nukleozydów,
• pronukleozydy,
• pronukleotydy,
• oligonukleotydy,
• kwasy nukleinowe,
•  nukleozydy acykliczne,
• nukleozydy 1,2,3-triazolu,
• aktywność antywirusowa,
• aktywność antynowotworowa,
• oddziaływania enzym-substrat,
• transglikozylacja,
• pronukleotydy anty-HIV,
• pronukleotydy antynowotworowe,
• H-fosfoniany,
• stereochemia fosforu 

Chemia nukleotydów

• badania podstawowe nad metodami syntezy, właściwościami chemicznymi i fizykochemicznymi H-fosfonianów ze szczególnym uwzględnieniem H-fosfonianów nukleozydów  i ich analogów

• projektowanie i synteza nowych związków nukleotydowych (np. pronukleotydów) o potencjalnej  aktywności przeciwwirusowej (np. anty-HIV) lub przeciwnowotworowej

• badania ścieżek metabolicznych pronukleotydów w różnych środowiskach chemicznych i fizjologicznych

• chemia i stereochemia P-chiralnych analogów nukleotydów

• kataliza wewnątrzcząsteczkowa w stereospecyficznej syntezie wiązań internukleotydowych

Chemia nukleozydów

• poszukiwanie nowych podejść syntetycznych w syntezie zasad kwasów nukleozydowych i nukleozydów (kontrolowana degradacja, przegrupowania);

• synteza i charakterystyka analogów nukleozydowych o potencjalnej aktywności biologicznej, głównie analogów pirymidyny i puryny, pochodnych 1,2,3-triazolu, acyklonukleozydów, 2’-C-alkilorybonukleozydów i 2’,3’-dideoksynukleozydów;

• synteza i aktywność biologiczna analogów dinukleozydomonofosforanów, w których wiązanie internukleotydowe zastąpiono układem 1,2,3-triazolowym;

• badania mechanizmu i możliwości aplikacyjnych reakcji transglikozylacji;

prof.dr hab. Jerzy Boryski

profesor

prof. dr hab. Adam Kraszewski

profesor

prof. dr hab. Jacek Stawiński

profesor

Europejskie Centrum Bioinformatyki i Genomiki

Instytut Informatyki Politechniki Poznańskiej

Wielkopolskie Centrum Zaawansowanych Technologii

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk
ul. Z. Noskowskiego 12/14
61-704 Poznań
tel centrala: (+48) 61 852 85 03
fax: (+48) 61 852 05 32
e-mail: ibch@ibch.poznan.pl

Sekretariat Dyrektora, tel: 61 852 89 19