Dofinansowanie ze środków budżetu państwa
Deklaracja dostępności
RNAComposer to pierwszy na świecie w pełni automatyczny system do przewidywania struktury 3D RNA. Na podstawie wprowadzonej przez użytkownika informacji o sekwencji nukleotydów i – opcjonalnie – listy par zasad, system oblicza kształt cząsteczki w przestrzeni trójwymiarowej. Dzięki szybkości obliczeń i wysokiej jakości wyników, RNAComposer może być wykorzystywany do modelowania w czasie rzeczywistym nowych cząsteczek na potrzeby biomedycyny i medycyny spersonalizowanej. System wykorzystuje wiedzę zgromadzoną w bazie danych i inteligentnej wyszukiwarce RNA FRABASE dedykowanej cząsteczkom RNA. Został uruchomiony w 2012 r.; do lipca 2018 r. odnotował ok. 3 mln odwiedzin.
RNA FRABASE jest jednym z najlepszych źródeł kompletnej informacji o architekturze cząsteczek RNA i pierwszą bazą, która skupiła w jednym miejscu wszystkie parametry strukturalne oraz graficzne reprezentacje struktury na poziomie drugo- i trzeciorzędowym. baza wspomaga badania naukowe i edukację w zakresie biologii i bioinformatyki strukturalnej. Wykorzystywana jest m.in. przez system RNAComposer. Została uruchomiona w 2007 r.; do lipca 2018 r. odnotowała ok. 3 mln odwiedzin.
Baza danych RNAimmuno dostarcza informacje dotyczące niespecyficznych efektów występujących w komórkach podczas badań interferencji RNA i regulacji za pomocą mikroRNA. Często zachodzą wówczas niespodziewane odpowiedzi immunologiczne, niespecyficzne dla sekwencji. RNAimmuno gromadzi opublikowane dane dotyczące tego typu niepożądanych skutków ubocznych.
Kalkulatory LNA-2'OMeRNA. Proste, wygodne i podręczne kalkulatory on-line pozwalające na przewidywanie parametrów termodynamicznych, takich jak energia swobodna, entalpia, entropia i temperatura topnienia, dla dupleksów zawierających RNA natywne oraz RNA z nicią modyfikowaną w pozycjach 2′-O grupą metylową (2’OMeRNA).
Accessibility Tools
