Dofinansowanie ze środków budżetu państwa
Deklaracja dostępności
RNAComposer to system do przewidywania struktury 3D RNA, który w momencie uruchomienia w 2012 roku był jedynym w pełni automatycznym narzędziem tego rodzaju na świecie. Do dziś, dzięki szybkości obliczeń, wysokiej jakości wyników, niezawodności oraz wyjątkowej przyjazności dla użytkownika, pozostaje najczęściej wykorzystywanym systemem predykcyjnym dedykowanym RNA. System umożliwia przewidywanie kształtu cząsteczki RNA w przestrzeni trójwymiarowej na podstawie informacji wprowadzonej przez użytkownika; sekwencji nukleotydów oraz opcjonalnie listy par zasad. Jego zastosowanie znajduje szczególne miejsce w biomedycynie i medycynie spersonalizowanej, gdzie czas i dokładność odgrywają kluczową rolę. W ciągu pierwszej dekady działania RNAComposer zrealizował ponad 60 milionów sesji obliczeniowych, obsługując użytkowników z całego świata i dostarczając nieocenionego wsparcia w badaniach naukowych, projektach przemysłowych i edukacji.
RNA FRABASE to jedno z najlepszych źródeł kompleksowej informacji o architekturze cząsteczek RNA pochodzących z badań eksperymentalnych. Jest to także pierwsza baza danych, która w jednym miejscu gromadzi wszystkie parametry strukturalne oraz graficzne reprezentacje RNA na poziomie drugo- i trzeciorzędowym. RNA FRABASE umożliwia efektywne przeszukiwanie kolekcji struktur według różnorodnych kryteriów, a także identyfikację motywów i fragmentów struktur o charakterystyce zadanej przez użytkownika. Baza wspiera badania naukowe i procesy edukacyjne w obszarze biologii i bioinformatyki strukturalnej. Jest również wykorzystywana przez inne narzędzia bioinformatyczne, takie jak system RNAComposer. Uruchomiona w 2007 roku, RNA FRABASE cieszy się niesłabnącym zainteresowaniem; do tej pory odnotowano ponad 4 miliony odwiedzin.
Kalkulatory LNA-2'OMeRNA. Proste, wygodne i podręczne kalkulatory on-line pozwalające na przewidywanie parametrów termodynamicznych, takich jak energia swobodna, entalpia, entropia i temperatura topnienia, dla dupleksów zawierających RNA natywne oraz RNA z nicią modyfikowaną w pozycjach 2′-O grupą metylową (2’OMeRNA).
