Pracownia Chemii Medycznej

dr Dorota Jakubczyk

Kierownik Pracowni

djakubczyk@ibch.poznan.pl
tel. wew. 1165

Działalność badawcza

Słowa kluczowe

Chemia medyczna
Optymalizacja cząsteczek „hit to lead”
Synteza chemiczna
Biosynteza, biokataliza, semi-synteza
Izolacja i identyfikacja produktów
Produkty naturalne
Chemoinformatyka

Oferta

Synteza chemiczna cząsteczek aktywnych biologicznie
Optymalizacja cząsteczek – „hit to lead” – chemoinformatyczne projektowanie oraz synteza
Biosynteza, biokataliza, semi-synteza dla związków trudnych do syntezy klasycznymi metodami
Dobór już istniejących bibliotek do testów bioaktywności
Zautomatyzowane oczyszczanie, izolacja i identyfikacja związków chemicznych – z materiału biologicznego lub reakcji enzymatycznych

Wyposażenie

Układ LCMS-8040 Shimadzu

Projekty badawcze

Wstępne badania nad chemicznym programowaniem grzybów przy użyciu Ramularia collo-cygni jako modelu. Celem projektu było stworzenie i optymalizacja metody wytwarzania nowych analogów metabolitów grzybiczych o potencjalnej bioaktywności. Wstępne wyniki dotyczące ścieżki biosyntetycznej rubelin, zostały potwierdzone, poprzez spektralną obserwację kluczowego produktu pośredniego, chryzofanolu, co zostało opublikowane. Zaobserwowano również kilka nowych pochodnych rubelin - Miniatura 4 - 2020/04/X/NZ1/01959 (Kierownik dr. Dorota Jakubczyk)

Wybrane publikacje

Dussart F., Jakubczyk D.*, Biosynthesis of Rubellins in Ramularia collo-cygni — Genetic Basis and Pathway Proposition. Int. J. Mol. Sci. (2022), 23, 3475
Jakubczyk D.*, Francois D. Selected Fungal Natural Products with Antimicrobial Properties. Molecules (2020), 25, 911: 1-18
Jakubczyk D., Caputi L., Stevenson C. E. M., Lawson D. M., O’Connor S. E. Structural characterization of EasH (Aspergillus japonicus) – an oxidase involved in cycloclavine biosynthesis. Chem. Comm. (2016) 52: 14306-14309
Jakubczyk D., O’Connor S. E. Privileged scaffolds in medicinal chemistry: Design, synthesis, evaluation. The Royal Society of Chemistry (2016) Chapter 14: Ergot Alkaloids
Jakubczyk D., Caputi L., Hatsch A., Nielsen C. A. F., Diefenbacher M., Klein J., Molt A., Schroeder H., Cheng J. Z., Naesby M., O’Connor S. E. Discovery and reconstitution of the cycloclavine biosynthetic pathway — enzymatic formation of a cyclopropyl group. Angew. Chem. Int. Ed. (2015) 54: 5117 –5121
Jakubczyk D., Cheng J. Z., O'Connor S. E. Biosynthesis of the ergot alkaloids. Nat. Prod. Rep. (2014) 31: 1328-1338
Jakubczyk D., Brenner-Weiß G., Bräse S. Synthesis of tritium labelled and photoactivatable N-acyl-L-homoserine lactones: Inter-kingdom signalling molecules. Eur. J. Org. Chem. (2014) 3: 592–597

IBCH logo