Pracownia Chemii Medycznej

dr Dorota Jakubczyk

Kierownik Pracowni

djakubczyk@ibch.poznan.pl
tel. wew. 1165

Działalność badawcza

Słowa kluczowe

Chemia medyczna
Optymalizacja cząsteczek „hit to lead”
Synteza chemiczna
Biosynteza, biokataliza, semi-synteza
Izolacja i identyfikacja produktów
Produkty naturalne
Chemoinformatyka

Oferta

Synteza chemiczna cząsteczek aktywnych biologicznie
Optymalizacja cząsteczek – „hit to lead” – chemoinformatyczne projektowanie oraz synteza
Biosynteza, biokataliza, semi-synteza dla związków trudnych do syntezy klasycznymi metodami
Dobór już istniejących bibliotek do testów bioaktywności
Zautomatyzowane oczyszczanie, izolacja i identyfikacja związków chemicznych – z materiału biologicznego lub reakcji enzymatycznych

Wyposażenie

Chromatograf Flash Biotage® Selekt
LCMS-8040 Shimadzu

Projekty badawcze

POL-OPENSCREEN 2.0 – Utrzymanie, Rozwój i Udostępnianie Polskiej Platformy Infrastruktury Skriningowej dla Chemii Biologicznej w Kontekście Uczestnictwa w Konsorcjum na Rzecz Infrastruktury Badawczej EU-OPENSCREEN ERIC - Dofinansowanie z programu Ministra Nauki „Wsparcie udziału polskich zespołów naukowych w międzynarodowych projektach infrastruktury badawczej.

FENG.02.04-IP.04-0010/24-00
POL-OPENSCREEN – Polska Platforma Infrastruktury Skriningowej dla Chemii Biologicznej Projekt współfinansowany ze środków Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach 2 priorytetu działania 2.4 Badawcza Infrastruktura Nowoczesnej Gospodarki program Fundusze Europejskie da Nowoczesnej Gospodarki

OPUS 2024/53/B/NZ5/01942
Kompleksowa analiza strukturalna i funkcjonalna mRNA p53 w celu identyfikacji drugo- i trzeciorzędowych struktur RNA istotnych w fizjologii, procesie nowotworzenia i rozwoju terapii chorób człowieka.

Wybrane publikacje

Gawel M., Malecki P.H., Sliwiak J., Stepniewska M., Imiolczyk B., Czyrko-Horczak J., Jakubczyk D., Marczak Ł., Plonska-Brzezinska M. E., Brzezinski K., A closer look at molecular mechanisms underlying inhibition of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase by transition metal cations. ChemComm (2024), 60, 11504 - 11507
Totoń E.*, Lisiak N., Romaniuk-Drapała A., Framski G., Wyszko E., Ostrowski T.*, Cytotoxic effects of kinetin riboside and its selected analogues on cancer cell lines. Bioorg. Med. Chem. Lett. (2024) 100:129628
Błaszczyk L., Ryczek M., Das B., Mateja-Pluta M., Bejger M., Śliwiak J., Nakatani K., Kiliszek A., Antisense RNA C9orf72 hexanucleotide repeat associated with amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia forms a triplex-like structure and binds small synthetic ligand. Nucleic Acids Res. (2024) 52, 11
Ostrowski T.*, Bioactive furanyl- or thienyl-substituted nucleobases, nucleosides and their analogues. Mini-Rev. Med. Chem. (2023) 23:633-650
Kiliszek A., Rypniewski W., Błaszczyk L.*, Exploring structural determinants and the role of nucleolin in formation of the long-range interactions between untranslated regions of p53 mRNA. RNA (2023), 29, 5
Dussart F., Jakubczyk D.*, Biosynthesis of Rubellins in Ramularia collo-cygni — Genetic Basis and Pathway Proposition. Int. J. Mol. Sci. (2022), 23, 3475
Baranowski D., Boryski J., Ostrowski T.*, 7-(β-D-Ribofuranosyl)-3-methylguanine: synthesis from guanine and comparative multinuclear NMR studies. J. Mol. Struct. (2022) 1250:131911
Orlicka-Płocka M., Fedoruk-Wyszomirska A., Gurda-Woźna D., Pawelczak P., Krawczyk P., Giel-Pietraszuk M., Framski G., Ostrowski T., Wyszko E.*, Implications of oxidative stress in glioblastoma multiforme following treatment with purine derivatives. Antioxidants (2021) 10:950
Jakubczyk D.*, Francois D. Selected Fungal Natural Products with Antimicrobial Properties. Molecules (2020), 25, 911: 1-18
Wawrzyniak D., Framski G., Januszczyk P., Ostrowski T., Baraniak D., Jahnz-Wechmann Z., Fogt J., Manikowski A., Baranowski D., Rolle K., Boryski J.*, 7-(β-D-Ribofuranosyl)guanine and its analogues modified in the sugar portion: synthesis and antiglioma properties. ChemistrySelect (2020) 5:13370-13375
Baranowski D., Framski G., Wyszko E.*, Ostrowski T.*, Studies on structure of kinetin riboside and its analogues by variable-temperature NMR. J. Mol. Struct. (2019) 1195:110-118
Troszok A., Kolek L., Szczygieł J., Ostrowski T., Adamek M., Irnazarow I.*, Anti-CyHV-3 effect of fluorescent, tricyclic derivative of acyclovir 6-(4-MeOPh)-TACV in vitro. J. Vet. Res. (2019) 63:513-518
Mukherjee S., Błaszczyk L., Rypniewski W., Falschlunger C., Micura R., Murata A., Dohno C., Nakatani K., Kiliszek A., Structural insights into synthetic ligands targeting A-A pairs in disease-related CAG RNA repeats. Nucleic Acids Res. (2019), 47, 20
Jakubczyk D., Caputi L., Stevenson C. E. M., Lawson D. M., O’Connor S. E. Structural characterization of EasH (Aspergillus japonicus) – an oxidase involved in cycloclavine biosynthesis. Chem. Comm. (2016) 52: 14306-14309
Jakubczyk D., Caputi L., Hatsch A., Nielsen C. A. F., Diefenbacher M., Klein J., Molt A., Schroeder H., Cheng J. Z., Naesby M., O’Connor S. E. Discovery and reconstitution of the cycloclavine biosynthetic pathway — enzymatic formation of a cyclopropyl group. Angew. Chem. Int. Ed. (2015) 54: 5117 –5121
Jakubczyk D., Cheng J. Z., O'Connor S. E. Biosynthesis of the ergot alkaloids. Nat. Prod. Rep. (2014) 31: 1328-1338

IBCH logo