Z-d Biologii Molekularnej i Systemowej

Dofinansowanie ze środków budżetu państwa

Deklaracja dostępności

Zakład Biologii Molekularnej i Systemowej

prof. dr hab. Mirosława Z. Naskręt-Barciszewska

prof. dr hab. Marek Figlerowicz

Kierownik Zakładu

marek.figlerowicz@ibch.poznan.pl
tel. wew. 1103

Pracownicy naukowi

dr Lucyna Budźko
adiunkt

dr Ireneusz Stolarek
adiunkt

mgr inż. Karolina Hoffa-Sobiech
asystent

dr Mikołaj Zaborowski
adiunkt

dr Marcin Jukiewicz
asystent

mgr Łukasz Ciecierski
asystent

dr Anna Wyrzykowska
adiunkt

mgr Kinga Piątek-Bajan
asystent

Pracownicy techniczni

mgr Jarosław Sikora
specjalista bioinformatyk

mgr Marcin Osuch
biolog

mgr Joanna Delimata-Raczek
specjalista biolog

lic. Katarzyna Zielezińska
biolog

Profesorowie afiliowani

dr hab. Zbigniew Warkocki
profesor Instytutu

Doktoranci

mgr Mariana Alegria
doktorant

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Rysunek-1-Udzial-RNA-w-procesach-regeneracji-i-wymiany-komorek

RNA jako regulator różnicowania i regeneracji
Niekodujące RNA jako sygnały molekularne
Rybonukleazy zaangażowane w metabolizm niekodujących RNA
Biogeneza i funkcje zewnątrzkomórkowych pęcherzyków błonowych
Białka zaangażowane w transport RNA między komórkami
Edycja RNA w procesach regulacyjnych i sygnalnych

Rysunek-2-Genomika-czlowieka--obszary-dzialalnosci

Archeogenomika – historia biologiczna populacji zamieszkujących Europę Centralną i Wschodnią
Zmienność genetyczna współczesnej populacji zamieszkującej na terenie Polski
Związek pomiędzy genotypem a osobniczymi cechami fizycznymi
Struktura chromatyny w procesach starzenia, nowotworzenia i regeneracji
Genomika w badaniach chorób człowieka

Słowa kluczowe

niekodujące RNA, modyfikacje RNA, rybonukleazy, zewnątrzkomórkowe pęcherzyki błonowe, transport RNA, deaminazy, chromatyna, genomika, genetyka, populacyjna, archeogenomika

Projekty badawcze

RPWP.02.01.01-30-0001/20 REGIONAL COVID-HUB. WRPO 2014-2020 – Działanie 2.1 Rozwój elektronicznych usług publicznych, Poddziałanie 2.1.1 Rozwój elektronicznych usług publicznych.
LIDER/30/0111/L-9/17NCBR/2018 Wykorzystanie enzymów AlD/APOBEC w mapowaniu modyfikacji cytozyny w kwasach nukleinowych. NCBiR LIDER 9.
POIR.04.01.02-00-0025/17-00 Mapa Mikrobiomu Polski. PO IR – Działanie 4.1 Badania naukowe i prace rozwojowe, Poddziałanie 4.1.2 Regionalne agendy naukowo-badawcze.
POIR.04.02.00-30-A004/16 Europejskie Centrum Bioinformatyki i Genomiki – Genomiczna Mapa Polski. PO IR – Działanie 4.2. Rozwój nowoczesnej infrastruktury badawczej sektora nauki
820431 LifeTime – Rewolucja w opiece zdrowotnej dzięki zrozumieniu zachowania ludzkich komórek podczas choroby. Komisja Europejska
2016/21/D/NZ3/00641 Demetylaza histonów JMJD3 jako epigenetyczny regulator procesów senescencji oraz nowotworzenia. NCN SONATA 11
2014/13/B/NZ2/03837 Poszukiwanie mechanizmów indukujących polimorfizm liczby kopii dużych fragmentów genomu oraz związków tego zjawiska z tworzeniem i ewolucją metabolicznych klastrów genów. NCN OPUS 7
2014/12/W/NZ2/00466 Dynastia i społeczeństwo państwa Piastów w świetle zintegrowanych badań historycznych, antropologicznych i genomicznych. NCN SYMFONIA 2.
Projekt Polskiej Platformy Infrastruktury Skriningowej dla Chemii Biologicznej (POL-OPENSCREEN) będącej częścią europejskiego konsorcjum EU-OPENSCREEN (European Infrastructure of Open Screening Platforms for Chemical Biology European Research Infrastructure Consortium). Dotacja MNiSW

Wybrane publikacje

Philips A, Nowis K, Stelmaszczuk M, Jackowiak P, Podkowiński J, Handschuh L, Figlerowicz M. Expression landscape of circRNAs in Arabidopsis thaliana seedlings and adult tissues. Frontiers in Plant Science 2020, in press
Philips A , Nowis K, Stelmaszczuk M , Podkowiński J, Handschuh L , Jackowiak P, Figlerowicz M. Arabidopsis thaliana cbp80, c2h2, and flk knockout mutants accumulate increased amounts of circular RNAs. Cells 2020; 9(9):E1937
Perrigue PM, Rakoczy M, Pawlicka KP, Belter A, Giel-Pietraszuk M, Naskręt-Barciszewska M, Barciszewski J, Figlerowicz M. Cancer stem cell-inducing media activates senescence reprogramming in fibroblasts. Cancers 2020; 12(7): 1745
Zmienko A, Marszalek-Zenczak M, Pawel Wojciechowski P, Samelak-Czajka A, Luczak M, Kozlowski P, Karlowski WM, Figlerowicz M. AthCNV: A Map of DNA Copy Number Variations in the Arabidopsis Genome. Plant Cell 2020; 32(6): 1797–1819
Stolarek I, Handschuh L, Juras A, Nowaczewska W, Kóčka-Krenz H, Michalowski A, Piontek J, Kozlowski P, Figlerowicz M. Goth migration induced changes in the matrilineal genetic structure of the central-east European population. Sci Rep. 2019; 9(1):6737
Jackowiak P, Lis A, Luczak M, Stolarek I, Figlerowicz M. Functional characterization of RNA fragments using high-throughput interactome screening. J Proteomics. 2019;193:173-183
Stolarek I, Juras A, Handschuh L, Marcinkowska-Swojak M, Philips A, Zenczak M, Dębski A, Kóčka-Krenz H, Piontek J, Kozlowski P, Figlerowicz M. A mosaic genetic structure of the human population living in the South Baltic region during the Iron Age. Sci Rep. 2018;8(1):2455
Handschuh L, Wojciechowski P, Kaźmierczak M, Marcinkowska-Swojak M, Łuczak M, Lewandowski K, Komarnicki M, Blazewicz J, Figlerowicz M, Kozlowski P. NPM1 alternative transcripts are upregulated in acute myeloid and lymphoblastic leukemia and their expression level affects patient outcome. J Transl Med. 2018, 16(1):232
Handschuh L, Kaźmierczak M, Milewski MC, Góralski M, Łuczak M, Wojtaszewska M, Uszczyńska-Ratajczak B, Lewandowski K, Komarnicki M, Figlerowicz M. Gene expression profiling of acute myeloid leukemia samples from adult patients with AML-M1 and -M2 through boutique microarrays, real-time PCR and droplet digital PCR. Int J Oncol. 2018, 52:656-678
Handschuh L. Not Only Mutations Matter: Molecular Picture of Acute Myeloid Leukemia Emerging from Transcriptome Studies. Journal of Oncology, 2019, 7239206
Jackowiak P, Hojka-Osinska A, Gasiorek K, Stelmaszczuk M, Gudanis D, Gdaniec Z, Figlerowicz M. Effects of G-quadruplex topology on translational inhibition by tRNA fragments in mammalian and plant systems in vitro. Int J Biochem Cell Biol. 2017;92:148-154
Jackowiak P, Hojka-Osinska A, Philips A, Zmienko A, Budzko L, Maillard P, Budkowska A, Figlerowicz M. Small RNA fragments derived from multiple RNA classes - the missing element of multi-omics characteristics of the hepatitis C virus cell culture model. BMC Genomics. 2017;18(1):502
Budzko L, Jackowiak P, Kamel K, Sarzynska J, Bujnicki JM, Figlerowicz M. Mutations in human AID differentially affect its ability to deaminate cytidine and 5-methylcytidine in ssDNA substrates in vitro. Sci Rep. 2017;7(1):3873
Philips A, Stolarek I, Kuczkowska B, Juras A, Handschuh L, Piontek J, Kozlowski P, Figlerowicz M. Comprehensive analysis of microorganisms accompanying human archaeological remains. Gigascience. 2017;6(7):1-13
Samelak-Czajka A, Marszalek-Zenczak M, Marcinkowska-Swojak M, Kozlowski P, Figlerowicz M, Zmienko A. MLPA-Based Analysis of Copy Number Variation in Plant Populations. Front Plant Sci. 2017;8:222
Zmienko A, Samelak-Czajka A, Kozlowski P, Szymanska M, Figlerowicz M. Arabidopsis thaliana population analysis reveals high plasticity of the genomic region spanning MSH2, AT3G18530 and AT3G18535 genes and provides evidence for NAHR-driven recurrent CNV events occurring in this location. BMC Genomics. 2016;17(1):893
Marcinkowska-Swojak M, Handschuh L, Wojciechowski P, Goralski M, Tomaszewski K, Kazmierczak M, Lewandowski K, Komarnicki M, Blazewicz J, Figlerowicz M, Kozlowski P. Simultaneous detection of mutations and copy number variation of NPM1 in the acute myeloid leukemia using multiplex ligation-dependent probe amplification. Mutat Res. 2016;786:14-26
Perrigue PM, Najbauer J, Barciszewski J. The histone demethylase JMJD3 at the intersection of cellular senescence and cancer. BBA Rev on Cancer 2016;1865(2):237-244
Perrigue PM, Najbauer J, Jozwiak AA, Barciszewski J, Aboody KS, Barish ME. Planarians as a model of aging to study the interaction between stem cells and senescent cells in vivo. Pathobiol Aging Age Relat Dis. 2015;5:30052
Kurzynska-Kokorniak A, Koralewska N, Pokornowska M, Urbanowicz A, Tworak A, Mickiewicz A, Figlerowicz M. The many faces of Dicer: the complexity of the mechanisms regulating Dicer gene expression and enzyme activities. Nucleic Acids Res. 2015;43(9):4365-80
Zmienko A, Samelak A, Kozlowski P, Figlerowicz M. Copy number polymorphism in plant genomes. Theor Appl Genet. 2014;127(1):1-18
Kurzynska-Kokorniak A1, Koralewska N, Tyczewska A, Twardowski T, Figlerowicz M. A New Short Oligonucleotide-Based Strategy for the Precursor-Specific Regulation of microRNA Processing by Dicer. PLoS One. 2013 Oct 29;8(10):e77703
Jackowiak P, Nowacka M, Strozycki PM, Figlerowicz M. RNA degradome – its biogenesis and functions. Nucleic Acids Res. 2011;39(17):7361-70

Koszyk

Twój koszyk jest pusty! Powrót do sklepu