Z-d Inżynierii Genomowej

Zakład Inżynierii Genomowej

prof. dr hab. Marta Olejniczak

Kierownik Zakładu

marta.olejniczak@ibch.poznan.pl
tel. wew. 1136

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Badania skupiają się obecnie w 4 głównych obszarach:

rozwijanie technologii edycji genomów oraz metod oceny jej efektywności i specyficzności,
wykorzystanie technologii edycji genomów do tworzenia modeli chorób oraz w terapii komórkowej i przedklinicznej chorób genetycznych,
badanie mechanizmów naprawy dwuniciowych pęknięć DNA w regionach mikrosatelitarnych z wykorzystaniem systemu CRISPR/Cas9,
wykorzystanie narzędzi genetycznych technologii RNAi w eksperymentalnej terapii chorób poliglutaminowych – badania przedkliniczne.

Słowa kluczowe

edycja genomu,
CRISPR/Cas9,
Cpf1,
naprawa DNA,
terapia genetyczna,
interferencja RNA,
miRNA,
choroba Huntingtona,
badania przedkliniczne.

Projekty badawcze

Assessing efficacy and safety of genome EDITing approaches for Sickle Cell Disease. EU - HORIZON EUROPE (MO)
Zastosowanie sztucznych miRNA do allelo-selektywnej terapii ataksji rdzeniowo-móżdżkowych spowodowanych ekspansją powtórzeń CAG. NCBiR - LIDER (AKZ)
Poszukiwanie nowych celów terapeutycznych w chorobach poliglutaminowych. NCN - OPUS (MO)
Allelo-selektywna terapia dla chorób poliglutaminowych z wykorzystaniem technologii interferencji RNA. NCN - PRELUDIUM BIS (MO)
Mikroskopowa identyfikacja białek zaangażowanych w naprawę DNA w regionach powtórzeń CAG. NCN - PRELUDIUM (MN)
Badanie mechanizmów naprawy DNA w modelu DRPLA z wykorzystaniem systemu CRISPR-Cas. NCN - PRELUDIUM (MD)
Wykorzystanie sztucznych miRNA w terapii choroby Huntingtona. NCN - PRELUDIUM (AKZ)
Znaczenie polimorfizmu długości ciągów CAG w patogenezie chorób nowotworowych. MEiN - PERŁY NAUKI (MK)

Projekt finansowany ze środków Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego w ramach programu "Perły Nauki"

Wybrane publikacje

Pewinska-Kolodziejczak et al., CAG-Targeting artificial miRNA With Reduced Off-Target Risk for Efficient Lowering of Pathogenic Polyglutamine Proteins. NAR Mol Med, 2026; 3, ugag023
Sledzinski P, Nowaczyk M, Smielowska MI and Olejniczak M* CRISPR/Cas9-induced double-strand breaks in the huntingtin locus lead to CAG repeat contraction through DNA end resection and homology-mediated repair. BMC Biology, 2024; 22:282
Kotowska-Zimmer A, Przybyl L, Pewinska M, Suszynska-Zajczyk J, Wronka D, Figiel M, and Olejniczak M* A CAG repeat-targeting artificial miRNA lowers the mutant huntingtin level in the YAC128 model of Huntington’s disease. Molecular Therapy Nucl. Acids, 2022; 28: 702-715
Karwacka M and Olejniczak M* Advances in modeling polyglutamine diseases using genome editing tools. Cells, 2022; 11, 517
Sledzinski P, Dabrowska M, Nowaczyk M, Olejniczak M*. Paving the way towards precise and safe CRISPR genome editing. Biotechnol Adv. 2021; 49:107737
Kotowska-Zimmer A, Pewinska M and Olejniczak M*, Artificial miRNAs as therapeutic tools: Challenges and opportunities. Wiley Interdiscip Rev RNA 2021; e1640
Sledzinski P, Nowaczyk M and Olejniczak M*, Computational Tools and Resources Supporting CRISPR-Cas Experiments. Cells. 2020, 9, 1288
Dabrowska M, Ciolak A, Kozlowska E, Fiszer A and Olejniczak M*, Generation of New Isogenic Models of Huntington’s Disease Using CRISPR-Cas9 Technology. Int J Mol Sci. 2020, 21, 1854
Kotowska-Zimmer A, Ostrovska Y and Olejniczak M*. Universal RNAi triggers for the specific inhibition of mutant huntingtin, atrophin-1, ataxin-3 and ataxin-7 expression. Mol Ther Nucl Acids 2020, 19:562-571.
Dabrowska M, and Olejniczak M*, Gene therapy for Huntington's disease using targeted endonucleases. Methods Mol Biol. 2020, 2056:269-284
Dabrowska M, Czubak K, Juzwa W, Krzyzosiak WJ, Olejniczak M*, Kozlowski P*. qEva-CRISPR: a method for quantitative evaluation of CRISPR/Cas-mediated genome editing in target and off-target sites. Nucleic Acids Res. 2018, 46:e101
Dabrowska M, Juzwa W, Krzyzosiak WJ, Olejniczak M* Precise excision of the CAG tract from the Huntingtin Gene by Cas9 Nickases, Front Neurosci. 2018, 12:75
Olejniczak M*, Kotowska-Zimmer A, Krzyzosiak WJ. Stress-induced changes in miRNA biogenesis and functioning, Cell Mol Life Sci., 2018, 75:177-191
Olejniczak M*, Urbanek M.O., Jaworska E, Witucki Ł, Szcześniak M.W., Makałowska I, Krzyzosiak WJ. Sequence-non-specific effects generated by various types of RNA interference triggers. BBA Gene Regul Mech. 2016, 1859:306-14
Olejniczak M*, Urbanek MU, Krzyzosiak WJ* The Role of the Immune System in Triplet Repeat Expansion Diseases. Mediators Inflamm. 2015, 873860,
Olejniczak M, Galka-Marciniak P, Polak K, Fligier A, Krzyzosiak WJ. RNAimmuno: A database of the nonspecific immunological effects of RNA interference and microRNA reagents. RNA 2012, 18:930-5
Olejniczak M, Polak K, Galka-Marciniak P, Krzyzosiak WJ. Recent advances in understanding of the immunological off-target effects of siRNA. Curr Gene Ther. 2011, 17
Olejniczak M, Galka P, Krzyzosiak WJ. Sequence-non-specific effects of RNA interference triggers and microRNA regulators. Nucleic Acids Res. 2010, 38: 1-16.

IBCH logo

Zakład Inżynierii Genomowej

Pracownicy naukowi

Pracownicy techniczni

Doktoranci

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Słowa kluczowe

Projekty badawcze

Wybrane publikacje

Adres

Address

Zakład Inżynierii Genomowej

Pracownicy naukowi

Pracownicy techniczni

Doktoranci

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Słowa kluczowe

Rys. 1

Rys. 2

Rys. 3

Rys. 4

Projekty badawcze

Wybrane publikacje

Adres

Address