Z-d Chemii Biopolimerów

Zakład Chemii Biopolimerów

dr hab. Marcin K. Chmielewski, prof. ICHB PAN

Kierownik Zakładu

chmielewskimk@ibch.poznan.pl
tel. wew. 1257

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Chemiczna synteza biopolimerów ze szczególnym uwzględnieniem kwasów nukleinowych, peptydów, węglowodanów, lipidów oraz ich modyfikacji.
Badania nad nowymi, funkcjonalnymi materiałami polimerowymi, wykazującymi potencjał aplikacyjny np. jako nośniki leków czy podłoża w chemicznej syntezie na fazie stałej.
Zastosowanie oryginalnej reakcji termocyklizacji w szerokim aspekcie syntezy chemicznej.
Technologia termowrażliwa jako narzędzie w projektowaniu grup ochronnych, nowej klasy znaczników fluorescencyjnych, katalizatorów o aktywności termozależnej, termouwalnialnych polimerów oraz termometrów molekularnych.
Jakościowo-ilościowa analiza instrumentalna z wykorzystaniem elektroforezy kapilarnej typu PVA, wysokosprawnej chromatografii kolumnowej HPLC z detektorami UV-Vis, fluorescencyjnym i Corona oraz analiza masowa MALDI-TOF-MS.
Synteza nowych funkcjonalnych biomateriałów, takich jak modyfikowana biokompatybilna chityna.
Synteza nowych związków kompleksowych prekursorów grup termolabilnych z metalami d-elektronowymi.
Poznanie natury chemicznej badanych związków, określenie mechanizmu zachodzących procesów oraz otrzymanie nowych użytecznych materiałów o zastosowaniu w szeroko pojętej dziedzinie life sciences.

Słowa kluczowe

biopolimery,
chemiczna synteza kwasów nukleinowych,
termolabijne znaczniki fluorescencyjne,
DNA,
RNA,
oligonukleotydy,
SPOS,
LPOS,
podłoża stałe,
CPG,
podłoża ciekłe,
modyfikacje,
trójfosforany,
trifosforany,
chityna,
termowrażliwość,
termolabilność,
cross-linking,
sieciowanie,
polimery,
RAFT,
biomateriały,
chityna,
peptydy,
PNA,
barwniki fluorescencyjne,
fluorescencja,
podczerwień,
FRET,
wygaszacz,
aptamery,
aminoalkohole,
kompleksy metali bloku d,
katalizatory termowrażliwe,
grupy funkcyjne,
nanostruktury,
nanourządzenia,
markery,
synteza wielkoskalowa,
polistyren,
HPLC,
elektroforeza kapilarna,
PVA,
MALDI.

Projekty badawcze

Development of universal fast-response platform based on RNA technology, ensuring the national drug and epidemiological safety (ABM Project Call: Development of innovative therapeutic solutions with RNA technology; projekt realizowany w konsorcjum z Polfa SA; kierownik Zadania nr 2: M.K. Chmielewski)
Opracowanie wielkoskalowej syntezy kwasów nukleinowych z wykorzystaniem podłoży hybrydowych (NCBiR, Program Operacyjny Inteligentny Rozwój 2014-2020 Szybka Ścieżka, projekt realizowany w konsorcjum, lider projektu: FutureSynthesis sp. z o.o., kierownik zadań z ramienia ICHB PAN: M.K. Chmielewski)
Wdrożenie metody wytworzenia 5’trifosforylowanych kwasów nukleinowych (NCBiR, TANGO, kierownik projektu: M.K. Chmielewski)

Wybrane publikacje

D. Krygier, M. Przybyła, and M. K. Chmielewski, “Microwave-Dependent Thermo-Release Approach for Oligonucleotides 5′-Phosphorylation,” Organic Letters, Feb. 2023, doi: 10.1021/ACS.ORGLETT.3C03924.
J. Brzezinska, S. Trzciński, J. Strzelec, and M. K. Chmielewski, “From CPG to hybrid support: Review on the approaches in nucleic acids synthesis in various media,” Bioorganic Chemistry, vol. 140, Nov. 2023, doi: 10.1016/j.bioorg.2023.106806.
M. Paluch, D. Wang, M. R. Buchmeiser, and M. K. Chmielewski, “Pyridin-2-yl-substituted smart polymers sensitive to thermally triggered side group cyclization,” European Polymer Journal, vol. 186, Mar. 2023, doi: 10.1016/j.eurpolymj.2023.111865.
B. Drabińska et al., “Structural and Spectroscopic Properties of Isoconazole and Bifonazole—Experimental and Theoretical Studies,” International Journal of Molecular Sciences, vol. 24, no. 1, p. 520, Jan. 2023, doi: 10.3390/IJMS24010520/S1.
E. Frydrych-Tomczak et al., “Structure and oligonucleotide binding efficiency of differently prepared click chemistry-type DNA microarray slides based on 3-azidopropyltrimethoxysilane,” Materials, vol. 14, no. 11, p. 2855, Jun. 2021, doi: 10.3390/MA14112855/S1.
M. Hyjek-Składanowska et al., “Disulfide bridge cross-linking between protein and the RNA backbone as a tool to study RNase H1,” Bioorganic & Medicinal Chemistry, vol. 28, no. 23, p. 115741, Dec. 2020, doi: 10.1016/J.BMC.2020.115741.
A. R. Stasińska, P. Putaj, and M. K. Chmielewski, “Disulfide bridge as a linker in nucleic acids’ bioconjugation. Part II: A summary of practical applications,” Bioorganic Chemistry, vol. 95, p. 103518, Jan. 2020, doi: 10.1016/J.BIOORG.2019.103518.

Wybrane patenty

Marcin K. Chmielewski, Jolanta Brzezińska, Stanisław Trzciński, Joanna Strzelec, Oskar Kołacki, Krzysztof Waligórski „Sposób syntezy kwasów nukleinowych oraz oligonukleotydów” P.447752
Marcin K. Chmielewski, Agnieszka Witkowska, Piotr Putaj, Jolanta Brzezińska „Znaczniki fluorescencyjne oraz sposób ich wytwarzania i zastosowanie” 06.12.2018 P. 428084, Patent 241227 2022-05-20
Marcin K. Chmielewski, Agnieszka Witkowska, Piotr Putaj, Jolanta Brzezińska „Sposób syntezy pochodnych pirydyn-2-yl-winylopirydynylowych (PvP)” 06.12.2018 P.428082, Patent RP240596 2022-02-10
Marcin K. Chmielewski, Agnieszka Witkowska, Piotr Putaj, Jolanta Brzezińska „Pochodne pirydyn-2-yl-winylopirydynylowych o właściwościach fluorescencyjnych oraz sposób ich syntezy” (06.12.2018, zgłoszenie P. 428083) Patent RP241502 2022-07-20
Marcin K. Chmielewski, Agnieszka Witkowska, Piotr Putaj, Jolanta Brzezińska “Method for fluorescence labeling of biological materials, thermally removable fluorescent labels for this method, and methods of their preparation and use” US2022025432A1 publ. 2022-01-27

IBCH logo

Zakład Chemii Biopolimerów

Pracownicy naukowi

Pracownicy techniczni

Doktoranci

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Słowa kluczowe

Projekty badawcze

Wybrane publikacje

Wybrane patenty

Adres

Address

Zakład ​​Chemii Biopolimerów

Pracownicy naukowi

Pracownicy techniczni

Doktoranci

Działalność badawcza

Tematyka badawcza

Słowa kluczowe

Wizualizacja koncepcyjna podłoża hybrydowego – CPG powlekanego polimerem

2 Modulowanie stabilności 2-pirydynylowych termolabilnych grup ochronnych grupy hydroksylowej za pomocą podejścia „przełącznika chemicznego”

Widma UV-Vis procesu cyklizacji wewnątrzcząsteczkowej dla PNIPAM0.80-PMPyAEA0.20

Fluorescencyjne barwniki 2-(pirydyn-2-ylo)winylopirydynowe i ich termokontrolowane uwalnianie

Metoda termouwalniania zależna od promieniowania mikrofalowego w 5′-fosforylacji oligonukleotydów

Projekty badawcze

Wybrane publikacje

Wybrane patenty

Adres

Address

Zakład Chemii Biopolimerów