Pracownia Testów i Obrazowania Molekularnego

dr Dorota Kwiatek

Kierownik Pracowni

dkwiatek@ibch.poznan.pl
tel. 1555

Działalność badawcza

Słowa kluczowe

Mikroskopia ultrawysokorozdzielcza, MINFLUX, FLIM, STED
Obrazowanie pojedynczych cząsteczek
Wysokoprzepustowe Badania Przesiewowe
Opracowywanie i rozwój testów molekularnych
Cell Painting
Analiza obrazu
Analiza danych

Oferta

Pracownia Testów i Obrazowania Molekularnego jest częścią Centrum Biologii Chemicznej ERIC w Instytucie Chemii Bioorganicznej PAN i oferuje dostęp do ekspertyzy i infrastruktury w zakresie opracowywania testów molekularnych oraz wykonywania wysokoprzepustowych badań przesiewowych, mikroskopii wysokoprzepustowej i analizy obrazu. Jest częścią konsorcjum POL-OPENSCREEN oraz EU-OPENSCREEN-ERIC, które współpracują z użytkownikami na całym świecie w celu identyfikacji biologicznie aktywnych cząsteczek i dekonwolucji mechanizmów ich działania.

Infrastruktura Pracowni jest częścią platformy do wielowymiarowego obrazowania procesów biologicznych, utworzonej w ramach projektu NEBI - Krajowego Ośrodka Badań Obrazowych w Naukach Biologicznych i Biomedycznych. Wyposażona jest w system mikroskopii ultrawysokorozdzielczej znajdujący się w ICHB PAN. Dzięki tej unikalnej technologii mikroskopu MINFLUX (tylko jednego z zaledwie kilku na świecie) można wykonywać obrazowanie z rozdzielczością poniżej 2 nm. Nasz system mikroskopowy MINFLUX zapewnia technologie obrazowania w super rozdzielczości tj. STED, FLIM, Minflux.

Wyposażenie

Minflux – mikroskop ultrawysokorozdzielczy (Abberior)
Opera Phenix (Perkin Elmer).
Dozownik akustyczny Echo (Labcyte).
Dozownik płynów Multidrop combi (ThermoFisher).
Myjka do płytek Hydrospeed (Tecan)
Czytniki płytek CLARIOstar Plus (BMGLabtech) i Cytation (Biotek).

Projekty badawcze

Wybrane projekty

FENG.02.04-IP.04-0010/24-00
POL-OPENSCREEN – Polska Platforma Infrastruktury Skriningowej dla Chemii Biologicznej
Projekt współfinansowany ze środków Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach 2 priorytetu działania 2.4 Badawcza Infrastruktura Nowoczesnej Gospodarki program Fundusze Europejskie dla Nowoczesnej Gospodarki
Projekt POL-OPENSCREEN 2.0 – Utrzymanie, Rozwój i Udostępnianie Polskiej Platformy Infrastruktury Skriningowej dla Chemii Biologicznej w Kontekście Uczestnictwa w Konsorcjum na Rzecz Infrastruktury Badawczej EU-OPENSCREEN ERIC finansowany w ramach programu „Wsparcie udziału polskich zespołów naukowych w międzynarodowych projektach infrastruktury badawczej.

Wybrane projekty, dla których Pracownia realizuje zadania:

IMProving User experience, Long-term sustainability and Services of EU-OPENSCREEN (akronim IMPULSE); EU - program Horizon Europe, HORIZON- INFRA-2023-DEV-01, nr umowy: 101132028; kierownik projektu z ramienia ICHB PAN: dr hab. Jacek Kolanowski, lider zadania: dr Dorota Kwiatek
Bliskie spotkania trzeciego stopnia: co dzieje się kiedy rybonukleaza Dicer napotyka w komórce RNA i DNA przyjmujące struktury G-kwadrupleksów; NCN – konkurs OPUS 21, nr projektu: 2021/41/B/NZ2/03781; kierownik projektu: dr hab. Anna Kurzyńska-Kokorniak
Integrated Services for Infectious Disease Outbreak Research (akronim: ISIDORe); EU – program Horizon Europe, HE-HORIZON-INFRA-2021-EMERGENCY-02, nr umowy: 101046133; kierownik projektu z ramienia ICHB PAN: dr hab Jacek Kolanowski, w tym realizacja 2 współprac naukowych z:
- Dr. Sandeep Ghorpade, University of Cape Town, pt. Identification of validated hits against Mycobacterium tuberculosis caseinolytic protease complex ClpC1P1P2 from ECBL library; lider zadania: dr Dorota Kwiatek
- Prof. Bart Haagmans, Department of Viroscience, Rotterdam, pt. Viral Infectiology Research with Advanced Laboratory models (ISIDORe JRA VIRAL); lider zadania dr Dorota Kwiatek
Integrated assessment and advanced characterisation neuro-nanotoxicity (akronim: iCare); EU – program Horizon Europe, HORIZON-CL4-2022-DIGITAL-EMERGING-01, umowa nr 101092971; kierownik projektu z ramienia ICHB PAN: dr hab. Jacek Kolanowski
Poszukiwanie inhibitorów ludzkiej reduktazy δ1-pyrrolino-5-karboksylanu (PYCR1) jako cząsteczek wiodących w rozwoju nowych leków antynowotworowych; NCN – konkurs OPUS 21, nr projektu: 2021/43/B/NZ7/0161; kierownik projektu: dr hab. Miłosz Ruszkowski
Alternative gene ends:the crosstalk of RNA cleavage and transcription termination (akronim: Alternative Ends); EU – program Horizon Europe, ERC-2021-STG; kierownik projektu dr hab. Kinga Kamieniarz-Gdula, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu
Nanoscale Hippocalcin Signaling in Long-Term Depression in Norm and Primary Dystonia; Polska Akademia Nauk, program wsparcia naukowców z Ukrainy, nr umowy: PAN.BFB.S.BWZ.405.022.2023; kierownik projektu: dr Volodymyr Cherkas

Wybrane publikacje

[1] F. Canyelles I Font, K. Żukowski, M. A. Khan, D. Kwiatek, J. L. Kolanowski, Interference of metal ions on the bioluminescent signal of firefly, Renilla, and NanoLuc luciferases in high-throughput screening assays, Front. Chem. (2024) Nov 26:12:1436389. doi: 10.3389/fchem.2024.1436389

[2] A. Wychowaniec, F. Canyelles i Font, M. A. Khan, M. Gładysz, D. Kwiatek, J.L. Kolanowski Wieloanalitowe, małocząsteczkowe sondy luminescencyjne do symultanicznego wykrywania kilku celów molekularnych w modelach komórkowych, Postępy Biochemii (2024) 10.18388/pb.2021_538

[3] N. Karczewska, M. Pyc, K. Żukowski, J. Kosman, D. Kwiatek, J.L. Kolanowski Rola i wykorzystanie badań wysokoprzepustowych w poszukiwaniu związków chemicznych o działaniu terapeutycznym, Postępy Biochemii (2024) 10.18388/pb.2021_528

[4] M.Insińska-Rak, A. Golczak, M. Gierszewski, Z. Anwar, V. Cherkas, D. Kwiatek, E. Sikorska, I. Khmelinskii, G. Burdziński, R. Cibulka, L. Mrówczyńska, J.L. Kolanowski, M. Sikorski 5-Deazaalloxazine as photosensitizer of singlet oxygen and potential redox-sensitive agent, Photochemical and Photobiological Sciences 22 (2023) 1655-1671

[5] A. Golczak, D. Prukała, E. Sikorska, M. Gierszewski, V. Cherkas, D. Kwiatek, A. Kubiak, N. Varma, T. Pędziński, S. Murphree, R. Cibulka, L. Mrówczyńska, J.L. Kolanowski, M. Sikorski, Tetramethylalloxazines as efficient singlet oxygen photosensitizers and potential redox-sensitive agents, Scientific Reports 13426 (2023)

IBCH logo